本發(fā)明涉及植原體探針，包含該探針的基因芯片以及利用該基因芯片檢測(cè)植原體的方法。該植原體探針為針對(duì)11種植原體的特異性探針，點(diǎn)樣制成基因芯片，檢測(cè)植原體包括以下步驟：植物DNA樣品提取；利用通用引物對(duì)樣品特異性片段擴(kuò)增并對(duì)產(chǎn)物進(jìn)行標(biāo)記；雜交：將待測(cè)標(biāo)記的樣品加入雜交緩沖液中，混勻成雜交混合液，將混合液滴加入基因芯片的雜交區(qū)域，放入雜交盒雜交；取出雜交后的芯片并干燥后，進(jìn)行掃描及數(shù)據(jù)分析，判斷樣品中有無(wú)植原體的存在。利用本發(fā)明的探針制成的基因芯片可快速、高效、高通量檢測(cè)11種植原體。

1.探針，針對(duì)選自序列表中SEQ?ID?NO.?1植原體的16sDNA核苷酸序列，所述的探針序列選自表1中對(duì)應(yīng)植原體AY685056的一條特異性探針序列AY685056-10。2.如權(quán)利要求1所述的探針，其特征在于：進(jìn)一步包括選自表1中對(duì)應(yīng)植原體AY685056的特異性探針序列AY685056-1、AY685056-11、AY685056-2、AY685056-4、AY685056-5、AY685056-6、AY685056-8、AY685056-9中的一條或幾條的組合。3.基因芯片，包含如權(quán)利要求1-2中任一項(xiàng)所述的探針。4.如權(quán)利要求3所述的基因芯片，其特征在于：所述芯片還包含陰性對(duì)照和陽(yáng)性對(duì)照，陰性對(duì)照探針選取一段人類基因的保守序列選自序列表中SEQ?ID?NO.?17-20，與植原體序列沒(méi)有同源性，陰性對(duì)照探針選自表1中H28302128、H34916057、H4504152、H47060296對(duì)應(yīng)的序列；陽(yáng)性對(duì)照探針?lè)謩e來(lái)自于5個(gè)小鼠管家基因序列選自序列表中SEQ?ID?NO.?12-16，所述陽(yáng)性對(duì)照探針選自表1中M3116F01、M3116F10、M3116E05、M3116D01、M3157F03對(duì)應(yīng)的序列。5.如權(quán)利要求3所述的基因芯片，其特征在于：所述芯片包括上下兩個(gè)重復(fù)的點(diǎn)樣區(qū)，每個(gè)獨(dú)立的點(diǎn)樣區(qū)包括四個(gè)小的矩陣，每個(gè)矩陣包括8行19列共152個(gè)探針點(diǎn)，其中每一列為同一個(gè)探針的重復(fù)。6.如權(quán)利要求5所述的基因芯片，其特征在于：所述芯片基質(zhì)選自玻片、硅片、金屬片或膜中的一種。7.一種利用如權(quán)利要求3-6中任一項(xiàng)所述的基因芯片檢測(cè)廣州桑樹(shù)植原體的方法，包括以下步驟：（1）植物DNA樣品提取；（2）利用通用引物對(duì)樣品特異性片段擴(kuò)增并對(duì)產(chǎn)物進(jìn)行標(biāo)記，所述通用引物選自表2的6對(duì)通用擴(kuò)增引物為：Sense1、Antisense1、Sense2、Antisense2、Sense3、Antisense3、Sense4、Antisense4、Sense5、Antisense5、Sense6、Antisense6；陽(yáng)性對(duì)照為選自表2的外參照通用引物1和2；（3）雜交：將待測(cè)標(biāo)記的樣品加入雜交緩沖液中，混勻成雜交混合液，將混合液滴加入基因芯片的雜交區(qū)域，放入雜交盒雜交；（4）取出雜交后的芯片并干燥后，進(jìn)行掃描及數(shù)據(jù)分析，判斷樣品中有無(wú)廣州桑樹(shù)植原體的存在。8.如權(quán)利要求7所述的檢測(cè)植原體的方法，其特征在于：所述第（2）步擴(kuò)增及標(biāo)記包括以下工藝步驟：1）PCR擴(kuò)增：其中特異性擴(kuò)增反應(yīng)體系：DNA樣品???????????????????????0.1μg擴(kuò)增引物對(duì)??????????????????????1μL10×PCR?Buffer???????????????????2μL2.5mM?d(AGT)TP?mix??????????????2μL0.25mM?dCTP?????????????????????2μL25μM?Cy3-dCTP??????????????????2μLrTaqase?????????????????????????0.3μL加滅菌水至終體積????????????????20μL特異性擴(kuò)增反應(yīng)條件：95℃×5分鐘；95℃×15秒，55℃×15秒，72℃×15秒共40個(gè)循環(huán)；72℃延伸5分鐘，4℃冷卻；2）采用QIAquick?PCR?Purification?Kit純化擴(kuò)增標(biāo)記產(chǎn)物，步驟如下：a）加入5倍體積的Buffer?PB，混勻后，轉(zhuǎn)移到mini?spin?純化柱中；b）離心13000rpm×1分鐘，棄收集套管中的液體；c）加入500μL緩沖液PE，離心13000?rpm×1?min，棄收集套管中的液體；d）重復(fù)操作c）一次；e）不加試劑，離心13000?rpm×1?min，棄去收集套管，換成1.5ml的離心管；f）加入Buffer?EB?40μL，離心13000?rpm×1?min；g）再加入Buffer?EB?20μL，離心13000?rpm×1?min，合并純化產(chǎn)物。9.如權(quán)利要求7所述的檢測(cè)植原體的方法，其特征在于：所述第（3）步驟雜交工藝進(jìn)一步包括以下步驟：1）預(yù)雜交或預(yù)處理：將芯片放入盛有預(yù)雜交緩沖液的染色缸中進(jìn)行預(yù)處理20-30分鐘，之后取出芯片并吹干表面；2）雜交：將標(biāo)記好的樣品抽干后重溶于3μL滅菌水，95℃水浴變性5分鐘，冰上冷卻5分鐘，加入32μL雜交緩沖液，混勻成雜交混合液，將混合液滴加入基因芯片的雜交區(qū)域，蓋上蓋玻片，將芯片放入雜交盒進(jìn)行雜交處理；3）洗片：雜交結(jié)束后取出芯片，放入盛有去離子水的染色缸中洗片，再放入盛有洗脫液的染色缸中洗片，之后取出芯片并吹干表面。