本發明公開了一種篩選少根紫萍葉生長相關的分子標記的方法，包括克隆體培養、基因組DNA提取、設計微衛星引物、PCR擴增和數據統計與分析。有益效果為：本發明可快速得到大量的經微衛星引物標記的少根紫萍的DNA序列，微衛星標記檢測速度快，可快速獲得少根紫萍Sp10、Sp14、Sp42、Sp47、Sp51、Sp52和Sp53遺傳標記基因座呈現高度遺傳變異的多態性圖譜。少根紫萍葉長和葉寬均與Sp10、Sp14、Sp42、Sp47、Sp51、Sp52和Sp53顯著相關（除Sp51位點P<0.05，其余P<0.001）。了解基因型差異對紫萍生長以及污染物凈化能力的影響，提高廢水的生物治理效率。

1.與少根紫萍葉生長相關的分子標記的微衛星引物，其特征在于，所述微衛星引物為：Sp10：F: CCATCTGTCGTCCTTTTTCCC；R: CGCCCCATCACTTATTTCGTA；Sp14：F:GTCCATCCTTCTCAGCACAAT；R: CCGTACAAGATCTAAGCCTTT；Sp42：F: TGAGATCAGGCTGGAGCAGTG；R: GTTTACGTGGGCTACCAAACA；Sp47：F: TGGGCCTATGGCGATTAGGGG；R:GCGGCATCCACGGAGAAAATG ；Sp51：F: CTCGCACATCAGTTCACAGGA；R: TCAGACATCTGGCGCAGTAGA和Sp52：F: GTCCTCCCTTTGATTGCTCGTC；R: AAGCATCATGGGCTCTTCAGG。