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可區分HBV B型和非B型的雙探針實時定量PCR法

  • 專利類型:發明專利
  • 有效期:不限
  • 發布日期:2022-01-19
  • 技術成熟度:通過中試
交易價格: ¥面議
  • 法律狀態核實
  • 簽署交易協議
  • 代辦官方過戶
  • 交易成功

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  • 技術(專利)類型 發明專利
  • 申請號/專利號 CN201310332853.0 
  • 技術(專利)名稱 可區分HBV B型和非B型的雙探針實時定量PCR法 
  • 項目單位 福建醫科大學附屬第一醫院
  • 發明人 歐啟水,王煒,曾勇彬 
  • 行業類別 醫藥制造-化學藥品制劑
  • 技術成熟度 通過中試
  • 交易價格 ¥面議
  • 聯系人 周兆孌
  • 發布時間 2022-01-19  
  • 01

    項目簡介

    本發明涉及一種雙探針實時熒光定量PCR方法,更具體涉及一種可區分HBV B型和非B型的雙探針實時定量PCR法。本發明建立了一種基于型特異性堿基設計的雙探針實時定量PCR法,適用于B、C基因型流行的亞洲和太平洋地區HBV感染者HBV核酸定量的同時進行粗略基因分型,并且避免了其他少見基因型的漏檢。該方法包括以下步驟:(1)設計保守引物,及針對B型和非B型的Taqman探針;(2)提取血清樣本中HBV DNA;(3)雙探針實時熒光定量PCR,同時對HBV DNA進行分型和定量。本發明建立的雙探針實時定量PCR法準確、靈敏、特異、重復性好,可以同時進行HBV DNA的定量檢測和基因分型,適合于臨床推廣。
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  • 02

    說明書

    1.一種HBV基因分型的雙探針實時定量PCR檢測引物,其特征在于:引物如下:上游引物FCTAGACTCGTGGTGGACTTCTC,下游引物RATGAGGCATAGCAGCAGGAT,B型探針TCGCAGTCCCAAATCTCCAGTCACTC,非B型探針TCGCAGTCCCCAACCTCCAATCA;利用所述引物進行HBV基因分型的雙探針實時定量PCR法包括以下步驟:(1)通過對已明確基因型的HBV全基因組序列進行比對,選擇保守區設計保守引物,即上游引物F和下游引物R,同時選擇型特異性堿基聚集區設計針對B型和非B型的Taqman探針,其中B型探針5′端標記Hex熒光基團,非B型探針5′端標記FAM熒光基團,兩者3′端均標記猝滅基團;(2)提取血清樣本中HBV?DNA;(3)雙探針實時熒光定量PCR:保守引物能擴增所有基因型HBV?DNA,而B型探針只能結合B基因型HBV?DNA,非B型探針能結合余下所有基因型HBV?DNA,然后在PCR反應進行時,Taqman探針被Taq酶水解而發出熒光,通過監測擴增曲線,并記錄熒光閾值,同時對HBV?DNA進行分型和定量。2.根據權利要求1所述的HBV基因分型的雙探針實時定量PCR檢測引物,其特征在于:雙探針實時熒光定量PCR的反應體系:?2×Premix?Ex?Taq?10μl,20μmol/L上游引物F?0.2μl,20μmol/L下游引物R?0.2μl,20?μmol/L?B型探針0.3μl,20?μmol/L非B型探針0.3μl,50×ROX?0.4μl,模板2μl,ddH2O?6.6μl,總體積20μl;反應條件:95℃?30s?,95℃?5s、60℃?30s?40個循環,在60℃選擇Hex和FAM通道采集熒光信號,分別代表B基因型和非B基因型擴增,結果用ABI?StepOne?plus軟件確定各樣品的循環閾值。3.根據權利要求1所述的HBV基因分型的雙探針實時定量PCR檢測引物,其特征在于:以B基因型質粒作為B型擴增的標準品,C基因型質粒作為非B型擴增的標準品,分別繪制B基因型和非B基因型標準曲線,通過標準曲線對未知樣品定量;同時對HBV?DNA進行分型,若僅在Hex通道檢出紅色擴增曲線為B基因型,若僅在FAM通道檢出綠色擴增曲線為非B基因型;若同時在Hex和FAM通道檢出擴增曲線為混合基因型。
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