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一種檢測單核苷酸多態(tài)性的方法

  • 專利類型:發(fā)明專利
  • 有效期:不限
  • 發(fā)布日期:2022-01-16
  • 技術(shù)成熟度:已有樣品
交易價格: ¥面議
  • 法律狀態(tài)核實
  • 簽署交易協(xié)議
  • 代辦官方過戶
  • 交易成功

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  • 技術(shù)(專利)類型 發(fā)明專利
  • 申請?zhí)?專利號 CN201310045649.0 
  • 技術(shù)(專利)名稱 一種檢測單核苷酸多態(tài)性的方法 
  • 項目單位 中國科學(xué)院成都生物研究所
  • 發(fā)明人 唐卓,周麗 
  • 行業(yè)類別 健康用品-營養(yǎng)保健品
  • 技術(shù)成熟度 已有樣品
  • 交易價格 ¥面議
  • 聯(lián)系人 孫潤琳
  • 發(fā)布時間 2022-01-16  
  • 01

    項目簡介

    本發(fā)明屬于分子生物學(xué)技術(shù)領(lǐng)域,涉及單核苷酸多態(tài)性的分析檢測,具體涉及一種普適的利用缺口-連接酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)擴(kuò)增目標(biāo)DNA,將DNAzyme序列引入連接產(chǎn)物中,然后利用Lambda外切酶降解沒有參與連接反應(yīng)的磷酸化探針,及外切酶III釋放DNAzyme的檢測方法。本發(fā)明將DNAzyme探針與Gap-LCR探針相結(jié)合,通過在LCR體系中的待連接的一個磷酸化探針中加入一段DNAzyme序列,Gap-LCR擴(kuò)增反應(yīng)結(jié)束以后,向體系中加入Anti-G序列(與探針中的DNAzyme序列部分互補(bǔ)配對),利用Lambda外切酶降解5端磷酸化的DNA探針,然后利用外切酶III釋放連接產(chǎn)物中的DNAzyme,通過DNAzyme的特性來進(jìn)行SNP的定性和定量檢測。本發(fā)明具有簡單、方便、實用、經(jīng)濟(jì),廣泛適用于各種單核苷酸多態(tài)性檢測。
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  • 02

    說明書

    1.一種檢測單核苷酸多態(tài)性的方法,其特征是:在連接酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)Ligase?Chain?Reaction或
    者缺口-連接酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)Gap-LCR體系中加入兩組探針,其中一個5’-端磷酸化探針的3’-
    端用DNAzyme標(biāo)記,在進(jìn)行目標(biāo)核酸的鏈?zhǔn)竭B接酶擴(kuò)增反應(yīng)過程中,依次在DNA聚合
    酶和DNA連接酶的作用下將DNAzyme引入到擴(kuò)增產(chǎn)物中,LCR擴(kuò)增以后,向擴(kuò)增的產(chǎn)
    物中引入能與DNAzyme的序列部分互補(bǔ)的阻斷序列Anti-G,同時加入終濃度為100mM
    的NaCl以促進(jìn)Anti-G和DNAzyme更好的形成雙鏈結(jié)構(gòu),然后利用Lambda外切酶選擇
    性切割雙鏈DNA中的5’-端磷酸化的DNA探針,而對連接產(chǎn)物不起作用,此時體系中主
    要存在著沒有磷酸化的探針和連接產(chǎn)物,接著利用外切酶III降解雙鏈DNA的3’-端為平
    末端或者凹陷末端的序列,從DNA鏈的3’-端釋放單磷酸核苷酸,產(chǎn)生單鏈DNA片段,
    將連接產(chǎn)物中的DNAzyme標(biāo)記釋放,通過檢測LCR消化產(chǎn)物中釋放出的DNAzyme標(biāo)記
    物來進(jìn)行單核苷酸多態(tài)性的定性或定量分析;寡核苷酸探針中含有一段15個堿基以上的
    序列能與目標(biāo)核酸序列互補(bǔ),阻斷序列Anti-G與DNAzyme序列有12個堿基的序列完全
    互補(bǔ)配對,使DNAzyme序列處于封閉狀態(tài),以保證Lambda外切酶能夠徹底消化LCR擴(kuò)
    增反應(yīng)以后體系中剩余的含DNAzyme序列的磷酸化探針,從而降低檢測背景;本方法不
    以疾病診斷和治療為目的。
    2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的單核苷酸多態(tài)性的檢測方法,其特征是:所述寡核苷酸探針中的
    DNAzyme標(biāo)記是一種能夠產(chǎn)生信號的、具有過氧化物酶催化功能的DNA序列。
    3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的單核苷酸多態(tài)性的檢測方法,其特征是:所述核酸聚合酶是一種不
    具有5’-3’和3’-5’外切酶活性的耐熱性核酸聚合酶。
    4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的單核苷酸多態(tài)性的檢測方法,其特征是:所述核酸連接酶是一種具
    有耐熱性的核酸連接酶。
    5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的單核苷酸多態(tài)性的檢測方法,其特征是:所述的Lambda外切酶是
    一種5’-3’外切脫氧核糖核酸酶,能選擇性切割雙鏈DNA中的5’-端磷酸化的DNA序列,
    對單鏈DNA和未磷酸化DNA的活性較低、對含有切口的DNA無活性、對缺口的DNA
    活性有限。
    6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的單核苷酸多態(tài)性的檢測方法,其特征是:所述的外切酶III是一種
    具有3’-5’的脫氧核糖核酸酶活性的外切酶,降解雙鏈DNA的平末端,5’-突出末端或切口,
    從DNA鏈的3’-端釋放5’-單磷酸核苷酸,產(chǎn)生單鏈DNA片段;該酶對具有至少有4個堿
    基且末端不是C殘基的3’-突出末端的DNA、單鏈DNA、硫代磷酸酯連接的核苷酸無活
    性。
    7.根據(jù)權(quán)利要求1所述的單核苷酸多態(tài)性的檢測方法,其特征是:所述寡核苷酸探針有20-25
    個核苷酸與目標(biāo)核酸序列互補(bǔ)配對,DNAzyme序列不包含在此片段中。
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專利技術(shù)附圖

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